對于運行中的潔凈室，末端高效過(guò)濾器的價(jià)值并不高，全部加起來(lái)可能還不到用戶(hù)幾個(gè)小時(shí)的產(chǎn)值，但更換末端高效過(guò)濾器的風(fēng)險和間接費用會(huì )很高。更換過(guò)濾器時(shí)要停產(chǎn)，停產(chǎn)損失只有業(yè)主自己能算出來(lái)，這筆損失肯定比過(guò)濾器的備件費用高。
     更換高效過(guò)濾器是十分仔細的操作，潔凈室內的任何東西都可能價(jià)值昂貴，破壞一個(gè)部件其損失可能高于全部過(guò)濾器的費用。更換過(guò)濾器后要由專(zhuān)業(yè)人員進(jìn)行檢測，有時(shí)還要對空調系統進(jìn)行調試，還要經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的試運行。檢測、調試、試運行，三項費用加到一起，可能會(huì )與過(guò)濾器價(jià)格不相上下。聰明的業(yè)主總是希望盡可能地延長(cháng)高效過(guò)濾器的使用壽命，不是為了省過(guò)濾器那幾個(gè)錢(qián)，他們是想避免因更換過(guò)濾器而產(chǎn)生的一堆麻煩。
   　要延長(cháng)高效過(guò)濾器的使用壽命，最根本的辦法是將灰塵擋在預過(guò)濾器。更換預過(guò)濾器一般無(wú)須停產(chǎn)，無(wú)須調試，所以有經(jīng)驗的業(yè)主會(huì )把注意力和金錢(qián)花在預過(guò)濾器及保護級中級過(guò)濾器上。對于10K級和100K級潔凈廠(chǎng)房，預過(guò)濾選用G4、中級可選用F8過(guò)濾器（比色法95%），這樣，末端高效過(guò)濾器的使用壽命一般可達5年。在國外項目中和國內新建項目中，F8過(guò)濾器是非均勻流潔凈室最常見(jiàn)的預過(guò)濾器。
    　有些場(chǎng)合，對高效過(guò)濾器使用壽命的規定不是出于對阻力的考慮，而是其它因素。若廠(chǎng)房中有氫氟酸，而車(chē)間空調又不是全新風(fēng)系統，高效過(guò)濾器中的玻璃纖維濾紙會(huì )受到回風(fēng)的腐蝕，為了安全，必須定期更換高效過(guò)濾器。
       有些大的制藥廠(chǎng)，每年雨季過(guò)后要更換高效過(guò)濾器，為的是防止過(guò)濾器上任何可能的霉菌污染。有些生物實(shí)驗室和與危險品打交道的實(shí)驗室，在開(kāi)展一項新的重要課題前，為了可靠會(huì )要求使用新的高效過(guò)濾器。
      初效過(guò)濾器一般2-3個(gè)月更換一次，每半年更換一次，這樣高效過(guò)濾器的壽命一般能在2年以上； 　但為保護后級高級別過(guò)濾器使用及保障潔凈室安全運行，許多聰明的業(yè)主每月更換初效，每3個(gè)月更換中效及亞高效（或者前面所述風(fēng)柜內末段選用高效做保護過(guò)濾器），這樣可以保證高效過(guò)濾器5年（甚至10年）以上的使用壽命，而且因為更換后的新過(guò)濾器阻力小，空調負荷大大減少，而過(guò)濾器更換的費用遠小于空調運行所需的電費，頻繁更換前級預過(guò)濾器實(shí)際上是使空調在低阻力負荷下運行，節省了大量電費；